Fakulteter
VID er organisert i tre fakulteter.
Forskning
VID har en avdeling for forskning. Denne inneholder seksjon for bibliotek, forskningsdatahåndtering og historisk arkiv, i tillegg til seksjon for forskningsadministrasjon. Avdeling for forskning har tre strategiske sentre.
Utdanning
VID har en avdeling for utdanning med studieseksjonen og seksjon for internasjonalisering, og seksjon for læringssstøtte og digital utvikling (LoDU).
Administrasjon
I tillegg har VID en avdeling for administrasjon for virksomhetsutvikling med eiendoms- og driftsseksjonen, HR-seksjonen, IT-seksjonen, økonomiseksjonen og seksjon for kommunikasjon og markedsføring, og studentprest og studentdiakon.